Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- formats_standards_de_donnees [2016/10/12 11:37]
e.catteau@cbnbl.org [FSD META]
+++ formats_standards_de_donnees [2022/03/07 12:00] (Version actuelle)
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   * la table [[fsd:entite_biblio|entite_biblio]] rassemble les informations biblio concernant la description/détermination du taxon.
-NB : Tout envoi de donnée utilisant le FSD DATA __doit être accompagné__ d'un envoi avec le FSD META (les métadonnées)
+NB : Tout envoi de données utilisant le FSD DATA __doit être accompagné__ d'un envoi avec le FSD META (les métadonnées)
 Retrouvez tous les champs du FSD TAXA sur le Codex à l'adresse suivante : http://codex.fcbn.fr/flore/fsd/index.php#taxa
 ===== FSD SYNDATA =====
-Le FSD SYNDATA doit être homogénéisé vis-à-vis des travaux réalisé sur le DATA, TAXA et SYNTAXA. Un premier exercice a été réalisé avec le CBN FRC en 2014 - 2015. Voici la {{ ::cadrage_exercice_2014_syndata.docx |note de cadrage}} et le {{ :fcbn_fsd_syndata_v0.9.xls |format standard utilisé}}.
+Le FSD SYNDATA doit être homogénéisé vis-à-vis des travaux réalisés sur le DATA, TAXA et SYNTAXA. Un premier exercice a été réalisé avec le CBN FRC en 2014 - 2015. Voici la {{ ::cadrage_exercice_2014_syndata.docx |note de cadrage}} et le {{ :fcbn_fsd_syndata_v0.9.xls |format standard utilisé}}.
-La structuration du DATA a été réfléchis pour accueillir au mieux le SYNDATA en suivant la philosophie suivante :
+La structuration du DATA a été réfléchie pour accueillir au mieux le SYNDATA en suivant la philosophie suivante :
   * Si l'on considère le syntaxon comme une entité biologique, la table observation peut accueillir les observation de syntaxon (en spécifiant que le type de l'entité est syntaxon => typ_ent = 'stx')
-  * Concernant les relevé de phytosociologique, il peuvent être accueilli dans la table relevé en tant que type de relevé spécifique (meth_releve = 'lf' pour levé phytosociologique).
+  * Concernant les relevés phytosociologiques, il peuvent être accueillis dans la table relevé en tant que type de relevé spécifique (meth_releve = 'lf' pour levé phytosociologique).
-L'adaptation du FSD SYNDATA aux standards actuels devrait donc se résumer à trouver un moyen simple et évitant des lourdeur (ne polluant pas les autres standards) pour ajouter les champs suivants aux standards :
+L'adaptation du FSD SYNDATA aux standards actuels devrait donc se résumer à trouver un moyen simple et évitant des lourdeurs (ne polluant pas les autres standards) pour ajouter les champs suivants aux standards :
   * La syntaxonomie (SS_ALLIANCE_OBS_MERE, ALLIANCE_OBS_MERE, SS_ORDRE_OBS_MERE, ORDRE_OBS_MERE, SS_CLASSE_OBS_MERE, CLASSE_OBS_MERE) => proposition = gérer cela dans une table entite_syntaxonomie (en profiter pour faire une table entite_taxonomie)
-  * Les informations de strates (STRATE_OBS, TYPE_STRATE_OBS, RECOUVREMENT_OBS, COEF_AB_DOM_OBS, SOCIABILITE_OBS) => proposition = réflexion a avoir sur les trio Relevé/Observation/Strate (Une observation par strate?)
+  * Les informations de strates (STRATE_OBS, TYPE_STRATE_OBS, RECOUVREMENT_OBS, COEF_AB_DOM_OBS, SOCIABILITE_OBS) => proposition = réflexion à avoir sur les trios Relevé/Observation/Strate (Une observation par strate?)
-  * Les informations sur la protocole/méthode d'abondance-dominance (METHOD_ABOND, AB_METHOD_ABS, AB_METHOD_LGUEUR, AB_METHOD_DSTCE_PT, AB_METHOD_SURF_QUAD, AB_METHOD_SURF_SSQUAD) => proposition = soit ajouter une table le protocole de releve (releve_protocole), soit géré comme un vocabulaire contrôlé plus complexe (décrire le protocole et utilisé un code pour spécifié que celui ci est utilisé dans le relevé).
+  * Les informations sur la protocole/méthode d'abondance-dominance (METHOD_ABOND, AB_METHOD_ABS, AB_METHOD_LGUEUR, AB_METHOD_DSTCE_PT, AB_METHOD_SURF_QUAD, AB_METHOD_SURF_SSQUAD) => proposition = soit ajouter une table le protocole de releve (releve_protocole), soit gérer comme un vocabulaire contrôlé plus complexe (décrire le protocole et utiliser un code pour spécifier que celui ci est utilisé dans le relevé).
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 {{ ::format_definitif_fiches_series_et_geoseries.docx |}}
-Bien plus qu'un format standard il s'agissait donc au final d'élaborer aussi un [[modele_conceptuel_de_donnees|modèle conceptuel de données]] et un [[modele_physique_de_donnees|modèle physique de données]] qui permettrait d'assurer à la fois la l'échange, le partage et la production de nouvelles données, voir leur diffusion.\\
+Bien plus qu'un format standard, il s'agissait donc au final d'élaborer aussi un [[modele_conceptuel_de_donnees|modèle conceptuel de données]] et un [[modele_physique_de_donnees|modèle physique de données]] qui permettrait d'assurer à la fois la l'échange, le partage et la production de nouvelles données, voire leur diffusion.\\
 Le FSD syntaxa présenté ici est donc une première version qui contient des divergences avec les format DATA et TAXA (utilisation de majuscule pour les noms de champs, gestion des métadonnées). Une harmonisation du format SYNTAXA avec les formats DATA ET TAXA est prévue à court terme.
 A l'instar du DATA et du TAXA, il s'accompagne d'une série de listes de vocabulaires contrôlés (notamment en ce qui concerne les variables environnementales) et d'une série de référentiels nomenclaturaux (taxonomiques et syntaxonomiques).\\
-**Tables principales**
+====Tables principales====
   * table [[fsd:st_serie_petitegeoserie|st_serie_petitegeoserie]]: Table contenant la nomenclature des séries et petites géoséries ainsi que leurs principaux descripteurs (univariés);
   * table [[fsd:st_geo_sigmafacies|st_geo_sigmafacies]] : Table de correspondance entre le(geo)sigmataxon et un faciès qui donne le (geo)sigmafacies;
   * table [[fsd:st_indicateurs_floristiques|st_indicateurs_floristiques]]: Indicateurs floristiques de chaque (geo)sigmafacies;
-  * table [[fsd:st_cortege_syntaxonomique|st_cortege_syntaxonomique]]: Cortège syntaxonomique de chaque geosigmafacies. Chaque syntaxon représente un stade dynamique du (geo)sigmasyntaxa. Ce stade peut être progressif ou regressif.;
+  * table [[fsd:st_cortege_syntaxonomique|st_cortege_syntaxonomique]]: Cortège syntaxonomique de chaque geosigmafacies. Chaque syntaxon représente un stade dynamique du (geo)sigmasyntaxa. Ce stade peut être progressif ou régressif;
   * table [[fsd:st_syntaxon|st_syntaxon]]: Table contenant les syntaxons et leurs principaux descripteurs (univariés);
   * table [[fsd:st_cortege_floristique|st_cortege_floristique]]: Cortège floristique qui accompagne le syntaxon;
-**Tables multivariées**
+====Tables multivariées====
   * table [[fsd:st_chorologie|st_chorologie]]: Table indiquant la chorologie de chaque syntaxon, série ou petite géosérie;
   * table [[fsd:st_biblio|st_biblio]]: Table qui recense les références bibliographiques en lien avec la description des syntaxons, des séries et géoséries;
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   * table [[fsd:st_correspondance_hic|st_correspondance_hic]]: Table de correspondance entre les végétations (syntaxon, (geo)sigmafacies, séries et petites géoséries) et les habitats de la directive habitat (N2000);
   * table [[fsd:st_correspondance_pvf|st_correspondance_pvf]]: Table de correspondance avec la typologie du PVF (PVF1 et PVF2);
-  * table [[fsd:st_etage_bioclim|st_etage_bioclim]] : Table indiquant l'appartenance d'un syntaxon,série ou petite géosérie à un ou plusieurs étages de végétation ;
+  * table [[fsd:st_etage_bioclim|st_etage_bioclim]] : Table indiquant l'appartenance d'un syntaxon, série ou petite géosérie à un ou plusieurs étages de végétation ;
   * table [[fsd:st_etage_veg|st_etage_veg]]: Table de correspondance entre le syntaxon-série-petite géosérie et l'étage de végétation;
-  * table [[fsd:st_geomorphologie|st_geomorphologie]]: Table d'appartenance d'une végétation à une ou plusieurs géomorphologie;
+  * table [[fsd:st_geomorphologie|st_geomorphologie]]: Table d'appartenance d'une végétation à une ou plusieurs géomorphologies;
-**Tables de métadonnées**
+====Tables de métadonnées====
   * table [[fsd:st_catalogue_description|st_catalogue_description]]: Table de métadonnées de description des catalogues;
   * table [[fsd:st_collaborateur|st_collaborateur]]: Table de collaborateur qui fait le lien entre les personnes, leur organisme et le catalogue auquel elles ont participé;
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   * table [[fsd:st_annuaire_personnes|st_annuaire_personnes]]: Table d'annuaire qui recense les personnes en lien avec la création des catalogues;
   * table [[fsd:st_suivi_enregistrement|st_suivi_enregistrement]]: Table de suivi des enregistrements (création et mise à jour);
-**
-Tables référentiels**
+====Tables référentiels====
   * table [[fsd:referentiel_taxo|referentiel_taxo]]: Table listant les taxons dans les différents référentiels taxonomiques;
   * table [[fsd:liste_geo|liste_geo]]: Table listant les territoires géographiques de référence pour la chorologie;
   * table [[fsd:st_ref_action_suivi|st_ref_action_suivi]]: Référentiel des types de suivi de données;
-  * table [[fsd:st_ref_categorie_seriegeoserie|st_ref_categorie_seriegeoserie]]: Référentiel des catégorie de série et de géoséries;
+  * table [[fsd:st_ref_categorie_seriegeoserie|st_ref_categorie_seriegeoserie]]: Référentiel des catégories de séries et de géoséries;
   * table [[fsd:st_ref_continentalite|st_ref_continentalite]]: Référentiel de la continentalité selon Landolt;
   * table [[fsd:st_ref_critique|st_ref_critique]]: Référentiel de la criticité des syntaxons;
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   * table [[fsd:st_ref_periode|st_ref_periode]]: Table qui référence les périodes optimales de végétation (liste de début et fin de chaque saison);
   * table [[fsd:st_ref_pvf|st_ref_pvf]]: Typologie du PVF (PVF1 et PVF2);
-  * table [[fsd:st_ref_rang_seriegeoserie|st_ref_rang_seriegeoserie]]: Référentiel des rangs de série et de géoséries (ce référentiel n'est pas encore normé par la Société phytosociologique de France- SPF);
+  * table [[fsd:st_ref_rang_seriegeoserie|st_ref_rang_seriegeoserie]]: Référentiel des rangs de séries et de géoséries (ce référentiel n'est pas encore normé par la Société phytosociologique de France- SPF);
   * table [[fsd:st_ref_rang_syntaxon|st_ref_rang_syntaxon]]: Référentiel des rangs de syntaxons;
   * table [[fsd:st_ref_reaction|st_ref_reaction]]: Référentiel de l'indice de pH selon Landolt (réaction);
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   * table [[fsd:st_ref_tete_serie|st_ref_tete_serie]]: Référentiel des stades de la série (ou géosérie);
   * table [[fsd:st_ref_trophie|st_ref_trophie]]: Référentiel de la trophie selon Landolt;
-  * table [[fsd:st_ref_type_facies|st_ref_type_facies]]: Référentiel des types de faciès;
+  * table [[fsd:st_ref_type_facies|st_ref_type_facies]]: Référentiel des types de cellules paysageres (anciennement "types de faciès");
   * table [[fsd:st_ref_type_physionomique|st_ref_type_physionomique]]: Référentiel des types physionomiques;
-  * table [[fsd:st_ref_type_seriegeoserie|st_ref_type_seriegeoserie]]: Référentiel des types de série et de géoséries;
+  * table [[fsd:st_ref_type_seriegeoserie|st_ref_type_seriegeoserie]]: Référentiel des types de séries et de géoséries;
   * table [[fsd:st_ref_type_synonymie|st_ref_type_synonymie]]: Référentiel des types de synonymie;
   * table [[fsd:st_ref_type_taxon|st_ref_type_taxon]]: Référentiel des types de taxons;